商标查询：在提交商标注册申请之前，建议先进行商标查询，以确保所选商标没有与已注册或已申请的商标重复或相似。这有助于避免后续可能遇到的异议或驳回情况。

准备申请文件：申请人需要准备好身份证明文件、主体资格证明文件以及商标图样等申请文件。如果是以个人名义申请，提供申请人基本身份信息影印件；以公司名义申请，提供公司法人的营业执照影印件。填写商标注册申请表，并提供申请人的基本信息（如身份/护照/营业执照扫描件）。对于非英文的文字商标，申请人需提供该文字商标相应的英译文和意译文。如果要求优先权，则需提供优先权文件的核证副本。国外申请人申请马来西亚商标需要委托当地律师并签署委托书（POA），并在中国公证处或贸促会法律部进行公证。商标使用宣誓书公证，申请人签署并在中国公证处或贸促会法律部进行公证。

提交申请：向马来西亚知识产权局（IPOL）提交商标注册申请。申请可以以纸件形式提交，也可以通过电子方式（如邮件）提交。

审查阶段：IPOL会对申请文件进行初步审查，主要检查申请要求和分类信息是否符合规定。实质审查则包括对商标显著性、是否违反禁注禁用条款和是否与在先商标形成冲突的审查。审查不能通过的则会下发驳回通知书并要求申请人在驳回通知载明的期限内予以答复。

公告期：初步审查通过后，商标申请将进行公告。公告期为两个月。在此期间，任何第三方都可以提出异议。

异议处理：如果在公告期内有第三方提出异议，申请人需在规定时间内提交反驳证据。IPOL将根据双方提供的证据和理由作出裁定。

核准注册：如果商标申请在公告期内未被提出异议，或者异议不成立，商标将被核准注册。IPOL将颁发商标注册证书，并在官方公报上刊登注册证书。

续展：马来西亚商标注册后的有效期为10年，自申请日起算。到期日前6个月内可以办理续展，宽展期6个月，此外还有6个月的复活期；续展有效期同样为10年。