马来西亚申请商标的流程如下：

商标查询：

在提交商标注册申请之前，建议先对商标进行查询，以确保所选商标没有与已注册或已申请的商标重复或相似。

商标查询可以通过马来西亚知识产权局（IPOL）的在线工具完成。

提交申请：

向马来西亚知识产权局（IPOL）提交商标注册申请。申请可以以纸件形式提交，也可以通过电子方式（如邮件）提交。

申请所需文件通常包括申请人信息、商标图样、商品和/或服务列表等。

如果要求优先权，则需提供优先权文件的核证副本。

实质审查：

IPOL会对申请文件进行初步审查，主要检查申请要求和分类信息是否符合规定；实质审查则包括对商标显著性、是否违反禁注禁用条款和是否与在先商标形成冲突的审查。

审查不能通过的则会下发驳回通知书并要求申请人在驳回通知载明的期限内予以答复。

公告期：

初步审查通过后，商标申请将进行公告。公告期为两个月。在此期间，任何第三方可以提出异议。

异议处理：

如果在公告期内有第三方提出异议，申请人需在规定时间内提交反驳证据。IPOL将根据双方提供的证据和理由作出裁定。

核准注册：

如果商标申请在公告期内未被提出异议，或者异议不成立，商标将被核准注册。IPOL将颁发商标注册证书，并在官方公报上刊登注册证书。

续展：

马来西亚商标注册后的有效期为10年，自申请日起算。到期日前6个月内可以办理续展，宽展期6个月，此外还有6个月的复活期；续展有效期同样为10年。