商业特许经营办理流程如下：

企业网上注册：

打开“商务部业务系统统一平台-企业端”，通过左下方“企业备案-国内贸易”板块找到并点击“商业特许经营备案”。网址为 https://ecomp.mofcom.gov.cn/，或通过商务部官网（http://www.mofcom.gov.cn/）页面中间“业务系统统一平台-企业端”、“商业特许经营信息管理”应用首页（http://txjy.syggs.mofcom.gov.cn/）右侧“企业登录”均可进入页面。

进入注册页面后，按照指标说明准确填写相关信息，包括特许人、直营店成立日期等关键信息将直接带入备案申报信息中且无法自主修改；联系人电子邮件、手机为接收和修改用户名及密码的凭证，务必确认填写无误后再提交。

企业网上填报：

特许人获得登录号和密码后，登录商业特许经营信息管理系统，进入“备案企业用户登录”栏目，输入用户名和密码，按照系统要求准确、完整填报备案材料，上报备案材料后告知窗口部门。系统中要求提交的有关材料电子版文档应上传原件的 PDF 格式扫描件。

商务主管部门审核：

商务主管部门自收到特许人提交的符合规定的材料之日起 10 日内予以备案，并通知特许人。特许人提交的文件、资料不完备的 7 日内补充提交，补充齐全之日起 10 日内予以备案。

企业网上打印并提交：

商务主管部门对企业网上填报的信息予以审核并通过后，企业登陆系统进行网上打印并装订成册，向市商务局提供纸质备案材料。

商务主管部门公告：

商务主管部门在商业特许经营信息管理系统网站上对特许人的备案信息进行公告。

企业备案成功：

公告后，企业的备案完成。