商务厅做对外投资备案的流程是先将备案所需资料提交电子版的给商务厅，商务厅先做审核，审核过程中如果由疑问会跟企业联系，咨询了解清楚，如果有文件不对要补，就还需要补充文件，待所有文件审核完成，并无问题后下发对外投资备案证书，企业收到对外投资备案证书后还需要去香港中联办做个报道。

发改委做对外投资备案的流程是先将备案所需资料提交电子版的给发改委做预审核，审核过程如果有问题就需要补充文件，如果没问题就提供纸本的所有文件递交给发改委，发改委审核完成后下发备案通知书给企业。