注册日本商标所需的材料确实包括申请表、身份证明和商标样本，除此之外，还需要提供其他一些相关文件。以下是详细列举的所需材料：

申请书：需要填写详细的申请书，表明申请人的信息、商标的详细信息以及指定商品或服务的类别。

商标样本：提供商标的图样，可以是图形标志、文字或其组合。对于颜色有特定要求的商标，还需说明颜色使用的细节。

申请人身份证明：个人申请者需提供身份证或护照复印件，公司申请则需提供营业执照或公司注册证书的复印件。

地址证明：若申请人的地址与身份证明文件上的地址不同，需提供显示新地址的公用事业账单或其他官方文件。

代理委托书：如果通过代理机构申请，需要提供经过公证的委托书。

指定商品或服务的详细列表：根据《尼斯分类》，列出希望获得保护的所有商品或服务。

使用证据：如果商标已经在某些地区使用，可能还需要提供商标的使用证据，如标签、广告材料等。

支付凭证：缴纳申请费的收据或证明。

优先权文件：如果在其他国家和地区已提交过相同的商标注册申请，且希望在日本申请中主张优先权，需提供相关的申请文件副本。

翻译件：所有非日文或英文的文件都需要提供日文或英文的翻译件，并可能需要进行公证。

特殊声明：如果商标涉及某些特殊事项（例如声音、颜色、形状等），可能需要提供额外的解释或声明。