在马来西亚申请商标的流程主要包括以下步骤：

商标查询：在提交申请之前，建议进行商标查询，以确保所选商标没有与现有注册商标或申请中的商标相冲突。这有助于提高商标注册的成功率。

准备申请材料：申请人需要准备一系列文件，包括申请人的全名和地址（需使用英文）、需要保护的类别和商品/服务名称、商标图样（电子档）、代理授权委托书（POA，虽然不是必须的，但每件商标申请都需要提交一份经签署并经公证的法定声明原件1份）、以及商标使用宣誓书公证（签署文件并在中国公证处或贸促会法律部进行公证）。

提交申请：向马来西亚知识产权局（MyIPO）提交商标注册申请，并支付相应的申请费用。马来西亚商标官费为一标一类330马币（约合人民币545元），不包括商标查询费用、代理费、文件往来的费用等。

审查阶段：马来西亚知识产权局将对申请进行形式审查和实质审查。形式审查主要检查申请文件是否齐全和符合规定，而实质审查则涉及对商标显著性、是否违反禁注禁用条款以及是否与在先商标形成冲突的审查。

公告与异议：如果实质审查通过，商标将被公告，公告期为2个月。在此期间，任何第三方都可以对公告的商标提出异议。

核准注册：如果在公告期内无人提出异议或者异议不成立，马来西亚知识产权局将核准商标注册，并颁发注册证书。

此外，需要注意的是，整个注册过程可能需要1-2年的时间，具体时长取决于多种因素，如商标的类型、是否存在异议等。同时，马来西亚商标注册后有效期为10年，到期日前6个月内可以办理续展，宽展期为1个月，此外有6个月复活期；续展有效期同样为10年。