山东烟台企业办理境外投资备案的流程包括前期准备、内部决策、资料收集等。具体如下：

前期准备：明确投资目的国和项目性质，进行市场调研和风险评估，确保投资决策的合理性和可行性。

内部决策：召开股东会或董事会，形成关于境外投资的正式决议，这是启动备案流程的关键步骤。

资料收集：整理企业法人营业执照、最新财务审计报告、投资意向书、股东会/董事会决议等基础材料，以及《境外投资可行性研究报告》等专项材料。

商务局备案：向烟台市商务局提交申请，包括上述所有材料，申请《企业境外投资证书》。商务局将初步审核材料的完整性和合规性。

发改委备案：对于涉及特定行业或大额投资的项目，还需向发改委提交备案申请，获取立项批准文件。

外汇登记：持商务局出具的《企业境外投资证书》，前往国家外汇管理局烟台市中心支局办理外汇登记，获取《境外直接投资外汇登记证》。

资金汇出：凭外汇登记证，通过银行将投资资金汇往境外，完成投资实施。

总的来说，山东烟台企业办理境外投资备案是一个涉及多个部门、多个环节的复杂过程。企业在办理过程中应严格遵守相关法律法规和政策要求，确保投资行为的合法合规。同时，建议企业聘请有经验的法律顾问和财务顾问协助办理相关手续以降低风险并提高成功率。